American Museum of Natural History tengah menjalani renovasi sehingga semua penghuni museum bakal dipindahkan ke The Smithsonian Institute, museum terbesar di dunia yang terletak di Washington. Larry Daeley (Ben Stiller) terpilih sebagai petugas yang mengawal pemindahan barang-barang museum tersebut lantaran prestasinya sebelumnya.

Namun situasi menjadi kacau karena Dexter si monyet capuchin mencuri tablet Ahkmenrah ke Smithsonian. Sehingga seluruh penghuni museum terbesar di dunia itu mendadak bergerak hidup. Larry harus berhadapan dengan mantan Firaun Mesir yang berencana menguasai dunia dengan tablet Ahkmenrah. Selain itu Larry juga harus berhadapan dengan koleksi museum Smithsonian yang mencapai sekitar 136 juta benda peningalan masa lalu. Koleksi museum yang bangkit antara lain Amelia Earhart (Amy Adams), Theodore Roosevelt (Robin Williams), Albert Einstein (Eugene Levy), Ivan the Terrible (Christopher Guest), dan banyak lagi lainnya.

Bagaimana kelanjutannya??